Este crucero es el último de los tres que conmemoran el V Centenario de la Primera Circunnavegación, completada por 18 héroes, que arribaron a España capitaneados por Juan Sebastián de Elcano, que da nombre a este buque.
Está previsto que el barco visite los países que aportaron marinos a la expedición original hace 500 años. En este sentido, ya ha visitado El Pireo (Grecia) y Civitavecchia (Italia) y, más adelante, lo hará en Saint-Maló (Francia), así como diversas ciudades españolas como Barcelona, La Coruña y Santander, en las que se pretende difundir la gesta de este gran marino. El viaje se completará con la visita a varios puertos americanos, siendo el primero de ellos San Juan de Puerto Rico, para a continuación continuar navegando en demanda de La Habana y Miami.
Durante su escala en San Juan, está previsto llevar a cabo un encuentro con los Medios de comunicación el propio viernes 29 tras la atracada del buque en el muelle 1W y posteriores honores al Embajador de España en los Estados Unidos.
Se prevé efectuar la tradicional visita por parte de la dotación del buque-escuela a las religiosas de la congregación Siervas de María en la mañana del sábado. Asimismo, en la mañana del martes se desarrollará un acto de homenaje a Cristóbal Col